Однако Лыков не пожелал служить в полках под началом Черкасского и бил челом царю и патриарху Филарету... Кроме того, после своего назначения на полковую службу в 1631 г. Лыков приходил к патриарху Филарету «и говорил в Соборной церкви ему государю такие слова, что всякий человек, кто боится Бога, и помнит крестное целованье, и тот таких слов говорить не станет».
27 мая 1632 г. царь Михаил и патриарх Филарет строго выговорили Лыкову за то, что тот «своим гордым бездельным челобитьем и упрямством службу свою отказал и боярина князя Дмитрея Мамстрюковича обесчестил, и в государстве учинил многую смуту» и указали с него «доправить боярину князю Дмитрию Мамстрюковичу бесчестья вдвое 1200 рублев».